More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2767 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  1e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  96.43 
 
 
112 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  96.43 
 
 
112 aa  214  3e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  96.43 
 
 
112 aa  214  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  95.54 
 
 
112 aa  213  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  213  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  213  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  213  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  210  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  94.64 
 
 
112 aa  209  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 
112 aa  196  8e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  85.71 
 
 
114 aa  196  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  195  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
114 aa  195  2e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  81.25 
 
 
112 aa  191  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  186  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  80.36 
 
 
112 aa  186  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  186  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  186  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  184  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  184  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  6.34529e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  184  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  183  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  183  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  3.17831e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  183  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  182  1e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  182  2e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  178  3e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.89 
 
 
112 aa  177  5e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  177  5e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  75 
 
 
112 aa  176  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.37232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-05  hitchhiker  7.91345e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  75 
 
 
112 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  174  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  173  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  173  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
121 aa  172  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  173  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  172  1e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  74.11 
 
 
112 aa  172  2e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  171  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  171  3e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  4e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.56099e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  170  6e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  6e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  74.11 
 
 
112 aa  170  7e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  6.30678e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 
112 aa  169  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
133 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
117 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
117 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>