More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2559 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  89.25 
 
 		 400 aa  730    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  83.75 
 
 		 400 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  100 
 
 		 400 aa  823    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  93.75 
 
 		 400 aa  779    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  83.75 
 
 		 400 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  83.5 
 
 		 400 aa  714    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  84 
 
 		 400 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  87.75 
 
 		 400 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  86.5 
 
 		 400 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  85.5 
 
 		 400 aa  729    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  72.36 
 
 		 398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  70.25 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  70.43 
 
 		 398 aa  594  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  71.61 
 
 		 398 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  71.79 
 
 		 398 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  70.35 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  69.23 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  62.16 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  62.75 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  61.15 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  61.15 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  61.15 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  61.15 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  60.65 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  60.65 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  60.9 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  62.25 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  60.4 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  61.65 
 
 		 400 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  60.15 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  60.4 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  61.15 
 
 		 398 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  60.15 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  61.15 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  56.86 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  50.5 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  50.51 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  53.23 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  52.74 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  51.61 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  49.75 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.5 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.5 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  45.36 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.37 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.37 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  47.61 
 
 		 409 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  47 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  48.1 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.17 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  48.27 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  44.78 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  47.37 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  47.7 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  45.48 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  47.22 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  47.87 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  45.86 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  48.62 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.43 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.95 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  47.37 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  46.62 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  44.86 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  46.02 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.53 
 
 		 405 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  45.75 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.5 
 
 		 415 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  42.21 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  47.5 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  48.12 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  45.94 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  45.52 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.44 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.8 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  45.69 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  45.45 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  45.45 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  45.34 
 
 		 404 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  45.45 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  45.45 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  46.62 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  45.45 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  45.45 
 
 		 402 aa  329  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  45.2 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  45.64 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.75 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>