96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0279 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2295  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  71.17 
 
 
437 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00133597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2532  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  73.68 
 
 
437 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.931179  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0279  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  100 
 
 
437 aa  914    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000469369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1553  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  74.14 
 
 
437 aa  669    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0244  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  80.55 
 
 
437 aa  737    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0126204  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2669  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  75.51 
 
 
437 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000187584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0526  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  73 
 
 
437 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0921  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  70.94 
 
 
437 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0079  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  69.89 
 
 
472 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1601  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  68.74 
 
 
472 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000022809  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2094  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  66.21 
 
 
474 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2201  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  65.75 
 
 
473 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4042  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  61.52 
 
 
424 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3187  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  55.11 
 
 
400 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0252  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  51.53 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2185  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  43.4 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.894109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1369  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  40.6 
 
 
434 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.105781  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1653  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.49 
 
 
423 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.625307  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0128  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.68 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.429843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2321  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  41.75 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1857  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  41.5 
 
 
408 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105958  normal  0.0849818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0036  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.23 
 
 
417 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000030158  normal  0.0400699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0694  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.68 
 
 
417 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000114169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0029  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.72 
 
 
417 aa  328  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.39758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1956  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  42.48 
 
 
418 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000200349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2485  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  39.57 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0564556  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1309  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  39.56 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.28628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2156  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  39.67 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1951  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  39.73 
 
 
419 aa  293  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.770019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1630  hydrogensulfite reductase  30.14 
 
 
340 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0853  hydrogensulfite reductase  28.64 
 
 
430 aa  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1213  hydrogensulfite reductase  27.51 
 
 
416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0907  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  28.11 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1457  hydrogensulfite reductase  26.75 
 
 
412 aa  140  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0344  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  26.46 
 
 
412 aa  137  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0167672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0171  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  26.46 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1446  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  26.81 
 
 
414 aa  136  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0908  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  25.96 
 
 
377 aa  90.5  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0854  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  23.29 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0170  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  24.03 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1224  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  25.4 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1629  hydrogensulfite reductase  25.16 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.501606  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1445  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  24.04 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1212  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  25.16 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0345  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  24.03 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0163541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1456  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  23.7 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0253  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  22.73 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  22.55 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.07 
 
 
288 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.33 
 
 
618 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  24.61 
 
 
285 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3186  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  23.51 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00847169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4043  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  21.38 
 
 
366 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.57 
 
 
317 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.65 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2200  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  18.85 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  22.3 
 
 
322 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.45 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2531  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  21.05 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576489  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  23 
 
 
320 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  20.2 
 
 
307 aa  53.5  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1856  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  21.6 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00101342  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0245  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  19.65 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.199901  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.41 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  22.95 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  27.33 
 
 
521 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  20.82 
 
 
639 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.14 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2320  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  21.94 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00941255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  21.64 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0695  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  21.29 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.035571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0920  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  20.23 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2294  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  20.23 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2157  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  22.63 
 
 
357 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1554  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  20.53 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.815506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0527  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  19.65 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2670  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  20 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2435  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  29.2 
 
 
219 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.16 
 
 
301 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.59 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  20.89 
 
 
289 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.92 
 
 
550 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.89 
 
 
290 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  28.21 
 
 
516 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  21.92 
 
 
291 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  27.69 
 
 
834 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.33 
 
 
287 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2815  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.71 
 
 
852 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.487055  normal  0.890112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3159  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.57 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948016  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1562  sulfite reductase, beta subunit  21.21 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3664  hypothetical protein  25.58 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0137297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1597  sulfite reductase, assimilatory-type  23.91 
 
 
225 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.685806  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  20.18 
 
 
299 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25.68 
 
 
542 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  18.66 
 
 
291 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  20.34 
 
 
289 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>