50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0219 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 94 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  61.45 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  48.19 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  57.75 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  45.78 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  48.1 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  44.71 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.37 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  42.31 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.86 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  43.28 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  37.5 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  44.93 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.28 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  35 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.25 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  41.1 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  35.53 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  31.94 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  31.94 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.47 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.29 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  34.29 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  37.35 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  36.14 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  35.29 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  34.41 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  35.82 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  31.34 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  31.34 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  35.29 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  30.11 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  35.16 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  34.12 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  31.43 
 
 		 117 aa  42  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  38.98 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  37.14 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  30.59 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>