More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2921 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  100 
 
 
772 aa  1583    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  48.94 
 
 
583 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  43.5 
 
 
593 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.13 
 
 
589 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  44.86 
 
 
399 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.03 
 
 
405 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.96 
 
 
401 aa  353  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.2 
 
 
398 aa  351  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43 
 
 
397 aa  348  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.68 
 
 
397 aa  343  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.36 
 
 
397 aa  343  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.36 
 
 
397 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  41.69 
 
 
397 aa  342  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.36 
 
 
397 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  42.86 
 
 
404 aa  342  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  43.69 
 
 
396 aa  341  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  43.11 
 
 
397 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  42.75 
 
 
404 aa  340  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  42.68 
 
 
397 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  42.24 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  43.7 
 
 
401 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  41.34 
 
 
399 aa  337  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49.22 
 
 
399 aa  337  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  43.75 
 
 
400 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  43.75 
 
 
400 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  42.75 
 
 
403 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  42.5 
 
 
403 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  43.11 
 
 
404 aa  332  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  43.22 
 
 
404 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  43.22 
 
 
404 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  43.22 
 
 
404 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  43.22 
 
 
404 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  43.22 
 
 
404 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  41.23 
 
 
398 aa  330  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  41.94 
 
 
422 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  41.23 
 
 
398 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  42.14 
 
 
417 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  43.07 
 
 
401 aa  324  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  48.74 
 
 
398 aa  323  6e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  42.28 
 
 
398 aa  321  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  43.28 
 
 
406 aa  320  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  41.98 
 
 
398 aa  320  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  42 
 
 
397 aa  319  9e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  39.95 
 
 
397 aa  319  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  40.55 
 
 
396 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  41.6 
 
 
397 aa  318  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  48.26 
 
 
398 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.44 
 
 
408 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  41.16 
 
 
402 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  47.83 
 
 
404 aa  314  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  40.2 
 
 
400 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  39.55 
 
 
399 aa  313  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  40.55 
 
 
398 aa  312  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  41.13 
 
 
396 aa  313  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  47.83 
 
 
404 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  40.34 
 
 
411 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  40 
 
 
396 aa  312  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  40 
 
 
396 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  39.34 
 
 
397 aa  312  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  41.79 
 
 
406 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  39.55 
 
 
399 aa  311  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  49.38 
 
 
414 aa  310  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  42.49 
 
 
412 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  43.17 
 
 
399 aa  309  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  40.25 
 
 
398 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  39.3 
 
 
399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  41.48 
 
 
398 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  40.5 
 
 
395 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  45.43 
 
 
405 aa  307  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  43.65 
 
 
402 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  39.7 
 
 
397 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  40.44 
 
 
397 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  39.27 
 
 
399 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  39.75 
 
 
413 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  41.06 
 
 
398 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  39.85 
 
 
402 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  39.75 
 
 
400 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  42.26 
 
 
400 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  41.34 
 
 
398 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  39.3 
 
 
394 aa  303  8.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.04 
 
 
396 aa  303  9e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  39.9 
 
 
397 aa  303  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  42.01 
 
 
400 aa  303  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  42.01 
 
 
400 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  42.39 
 
 
425 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  40.15 
 
 
398 aa  302  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  39.85 
 
 
398 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  41.09 
 
 
414 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  40.15 
 
 
398 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>