14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1237 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  966    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  38.12 
 
 		 447 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  41.1 
 
 		 551 aa  226  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  28.54 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5090  hypothetical protein  60.64 
 
 		 123 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  28.75 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  28.89 
 
 		 400 aa  86.7  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  23.89 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  25.61 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  23.6 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  24.76 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  26.67 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  31.33 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  24.15 
 
 		 323 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>