151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1312 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 
462 aa  961  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 
458 aa  699  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  74.84 
 
 
462 aa  741  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.02075e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 
462 aa  735  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  72.16 
 
 
467 aa  728  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 
464 aa  645  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 
460 aa  700  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 
458 aa  703  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  69 
 
 
458 aa  697  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 
463 aa  688  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 
463 aa  688  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 
458 aa  699  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  68.98 
 
 
463 aa  681  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 
458 aa  698  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  83.98 
 
 
462 aa  841  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 
460 aa  704  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.03575e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  72.16 
 
 
467 aa  728  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  68.93 
 
 
458 aa  700  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
451 aa  583  1e-165  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  8.7846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
457 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 
434 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.9424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
456 aa  536  1e-151  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
461 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
443 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
445 aa  516  1e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
462 aa  515  1e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  55 
 
 
466 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 
433 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
462 aa  512  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
463 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
462 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  52.83 
 
 
461 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  53.39 
 
 
506 aa  507  1e-142  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
456 aa  504  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
465 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
456 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
490 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
466 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
473 aa  497  1e-139  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
462 aa  494  1e-138  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
468 aa  492  1e-138  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
462 aa  493  1e-138  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
467 aa  493  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
467 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
460 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
460 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
481 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
451 aa  489  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
468 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
468 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
468 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
471 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
462 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
459 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
461 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
461 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
478 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
461 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.3951e-12 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
461 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
459 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
445 aa  475  1e-133  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3146  glycyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
463 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
488 aa  469  1e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
448 aa  470  1e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
463 aa  469  1e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  50 
 
 
461 aa  465  1e-130  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
468 aa  466  1e-130  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
463 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
488 aa  461  1e-128  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
491 aa  460  1e-128  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
495 aa  461  1e-128  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
489 aa  459  1e-128  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
489 aa  459  1e-128  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01740  glycyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
511 aa  460  1e-128  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
462 aa  458  1e-128  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
460 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
489 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
489 aa  452  1e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
513 aa  453  1e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
515 aa  452  1e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1379  glycyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
516 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
463 aa  448  1e-125  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  45.63 
 
 
602 aa  447  1e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
494 aa  446  1e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
496 aa  443  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
502 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
509 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
504 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
459 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
476 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
458 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
551 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
508 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
504 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
525 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>