61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0845 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  100 
 
 		 336 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  57.81 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  52.96 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  48.53 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  49.84 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  47.92 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  46.13 
 
 		 316 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  42.63 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  42.86 
 
 		 322 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  40.97 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  43.51 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  43.18 
 
 		 294 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  46.79 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  41.04 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  42.71 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  42.36 
 
 		 308 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  42.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  42.36 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  41.91 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  40.07 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  43.71 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  43.79 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  42.05 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  43.79 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  35.82 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  32.93 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  32.34 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  26.86 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  29.8 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.13 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.72 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  29.3 
 
 		 545 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  29.49 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.72 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  30.17 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  30.07 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  29.49 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  26.39 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  28.39 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.68 
 
 		 565 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.2 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.68 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.57 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.97 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.52 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  30.2 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.52 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  30.2 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.44 
 
 		 605 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  28.25 
 
 		 588 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  28.39 
 
 		 579 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  25.11 
 
 		 579 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20570  putative chaperone  26.09 
 
 		 371 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.157015  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1765  putative chaperone  26.09 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>