27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0644 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0644  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3080  Vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  30.63 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2962  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  23.88 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.15104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0730  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  27.75 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0679  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  27.98 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.59696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2208  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  25.15 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000120286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3878  Vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  28.03 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0655  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  32.85 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.766498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23500  vitamin B12 dependent methionine synthase  28.48 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.730833  hitchhiker  0.000030345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0769  hypothetical protein  24.88 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1309  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  23.94 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  24.83 
 
 		 821 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  25.16 
 
 		 832 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  27.33 
 
 		 1182 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  31.36 
 
 		 1254 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  21.14 
 
 		 1274 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  30.58 
 
 		 1196 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  30.51 
 
 		 1208 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0060  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  30.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  30.17 
 
 		 1150 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  30.17 
 
 		 1150 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  30.17 
 
 		 1150 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  30.71 
 
 		 1168 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  40.38 
 
 		 1156 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  41.38 
 
 		 1136 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  43.48 
 
 		 1157 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  45.65 
 
 		 1158 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>