188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0064 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  100 
 
 
318 aa  627  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.94 
 
 
541 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.49 
 
 
541 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.1 
 
 
541 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.5 
 
 
541 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.77 
 
 
538 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.64 
 
 
548 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  39.2 
 
 
537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.8 
 
 
536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  36.62 
 
 
551 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  40.63 
 
 
557 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.31 
 
 
551 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  36.31 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  36.62 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  36.31 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  36.31 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  38.21 
 
 
537 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  36.31 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  36.31 
 
 
551 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  36.31 
 
 
551 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  36.95 
 
 
544 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.19 
 
 
564 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  37.69 
 
 
549 aa  202  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.78 
 
 
643 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.67 
 
 
554 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.61 
 
 
549 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.62 
 
 
636 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.27 
 
 
576 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.59 
 
 
587 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  37.88 
 
 
562 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.62 
 
 
551 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  38.22 
 
 
559 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.78 
 
 
556 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  38.95 
 
 
586 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.16 
 
 
567 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.41 
 
 
559 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.9 
 
 
555 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.9 
 
 
555 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.18 
 
 
566 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.28 
 
 
564 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  36.52 
 
 
555 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.18 
 
 
539 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.06 
 
 
574 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.28 
 
 
556 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  36.81 
 
 
592 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.98 
 
 
586 aa  170  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  34.31 
 
 
561 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.88 
 
 
304 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.42 
 
 
556 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.5 
 
 
565 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.45 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.18 
 
 
590 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.23 
 
 
563 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.56 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08740  Na-cotransporter  37.76 
 
 
308 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.1 
 
 
584 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  33.33 
 
 
535 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.27 
 
 
558 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0199  Na+/Picotransporter  35.83 
 
 
303 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  37.11 
 
 
289 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  33.96 
 
 
600 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.45 
 
 
556 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.65 
 
 
311 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.77 
 
 
570 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.11 
 
 
535 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  33.56 
 
 
566 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  31.97 
 
 
559 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  31.56 
 
 
308 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  31.37 
 
 
557 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 
554 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  31.66 
 
 
557 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  32.18 
 
 
578 aa  126  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0543  Na+/Pi-cotransporter  33.33 
 
 
616 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2510  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 
572 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1943  Na+/Pi-cotransporter  31.1 
 
 
584 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1050  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.3 
 
 
594 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1695  Na+/Picotransporter  30.98 
 
 
571 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.483825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.07 
 
 
552 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1891  Na+/Pi-cotransporter  30.98 
 
 
571 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.764459  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.03 
 
 
552 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0226  Na+/Pi-cotransporter  34.41 
 
 
608 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.07 
 
 
552 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.94 
 
 
549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  32.78 
 
 
543 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.44 
 
 
552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  28.29 
 
 
563 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.98 
 
 
562 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.57 
 
 
548 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  29.18 
 
 
611 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  30.51 
 
 
543 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.92 
 
 
543 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4194  Na+/Pi-cotransporter  26.42 
 
 
613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  30.58 
 
 
548 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.89 
 
 
548 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.21 
 
 
548 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.71 
 
 
546 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0549  Na/Pi-cotransporter, putative  32.88 
 
 
589 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0628  Na/Pi-cotransporter, putative  32.88 
 
 
550 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.85 
 
 
552 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  26.28 
 
 
543 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>