24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6848 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  52.76 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  51.38 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  44.44 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  43.98 
 
 		 348 aa  312  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  47.24 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  45.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  45.21 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  46.32 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  32.32 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  30.39 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  28.78 
 
 		 1055 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  29.46 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  26.3 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  26.12 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  27.34 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  25.71 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  24.83 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.330538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  23.02 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  23.02 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  23.02 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5987  hypothetical protein  23.44 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>