21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0895 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1007    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  29.76 
 
 
542 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  27.27 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  37.33 
 
 
725 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  38.27 
 
 
562 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  42.01 
 
 
547 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  33.89 
 
 
586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  32.44 
 
 
537 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  34.68 
 
 
271 aa  123  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  34.68 
 
 
271 aa  123  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  32.49 
 
 
518 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  28.45 
 
 
555 aa  98.2  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  25.69 
 
 
372 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  27.85 
 
 
570 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  25.36 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  25.62 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  25.12 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  26.07 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  20.71 
 
 
342 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  27.59 
 
 
773 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  23.93 
 
 
779 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>