More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1439 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 535 aa  1119    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  52.11 
 
 		 521 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  52.11 
 
 		 521 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  45.66 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  39.79 
 
 		 486 aa  339  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  36.31 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0350  transposase, IS4 family protein  29.84 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1000  transposase, IS4 family protein  29.84 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.309848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0767  ISCpe5, transposase  54.27 
 
 		 222 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0429535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0758  ISCpe5, transposase  51.16 
 
 		 154 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000330282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  26.09 
 
 		 472 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  26.09 
 
 		 472 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  25.65 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  25.45 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  25.45 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  28.25 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  28.25 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  25.15 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  28.25 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  25.72 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  25.72 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  26.72 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  26.48 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  26.68 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  26.92 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  25.35 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 419 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  25.05 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  25.35 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0766  ISCpe5, transposase  57.14 
 
 		 100 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00143398  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  25.98 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  26.45 
 
 		 452 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  26.45 
 
 		 452 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  25.9 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  25.9 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1616  transposase IS1182 family protein  25.14 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.452366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1776  transposase IS1182 family protein  25.14 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2937  transposase IS1182 family protein  25.14 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4390  transposase IS1182 family protein  25.14 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1112  transposase IS1182 family protein  25.14 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  26.04 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  25.1 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  25.76 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  24.31 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  26.26 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  26.26 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>