253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0350 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0350  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 536 aa  1120    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1000  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 536 aa  1120    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.309848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  35.45 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  35.08 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  30.43 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  28.4 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  28.4 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1571  hypothetical protein  94.51 
 
 		 103 aa  189  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.317317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  27.62 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1874  transposase IS4 family protein  42.55 
 
 		 227 aa  155  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1298  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.189796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0672  hypothetical protein  41.72 
 
 		 198 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0767  ISCpe5, transposase  36.41 
 
 		 222 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0429535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  24.02 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  27.57 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1395  transposase IS4 family protein  24.42 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 		 455 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1112  transposase IS1182 family protein  24.34 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1616  transposase IS1182 family protein  24.34 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.452366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1776  transposase IS1182 family protein  24.34 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4390  transposase IS1182 family protein  24.34 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2937  transposase IS1182 family protein  24.34 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0985  transposase, IS4 family protein  24.37 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  23.51 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  23.14 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  25.52 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1744  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3843  transposase, IS4 family protein  23 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686467  normal  0.224025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1786  transposase, IS4 family protein  23.44 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0677  transposase  34.11 
 
 		 130 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4064  transposase, IS4 family protein  22.89 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555455  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  24.1 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  24.1 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  24.1 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3135  transposase, IS4 family protein  22.75 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488104  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  22.56 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  23.42 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0273  transposase, IS4  23.68 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0241108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1536  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1749  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269011  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3125  transposase, IS4  23.68 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000237223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  24.27 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  24.27 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  23.69 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  22.27 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  28.28 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  22.57 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  24.04 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  22.37 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>