16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1734 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  59.12 
 
 
274 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  38.41 
 
 
268 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  37.01 
 
 
294 aa  175  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  40.69 
 
 
321 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  30.54 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  32.08 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  29.44 
 
 
246 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  29.08 
 
 
246 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  27.59 
 
 
245 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  26.94 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  25 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  26.26 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1403  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  25.45 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>