More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2434 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  70.45 
 
 
712 aa  1057    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  75.6 
 
 
712 aa  1115    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
711 aa  1445    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  71.09 
 
 
712 aa  1050    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  71.71 
 
 
712 aa  1085    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  76.79 
 
 
712 aa  1144    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  72.6 
 
 
713 aa  1072    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  43.91 
 
 
724 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  44.55 
 
 
698 aa  609  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  44.29 
 
 
680 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  45.63 
 
 
844 aa  603  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  42.98 
 
 
711 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  42.58 
 
 
829 aa  602  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  41.84 
 
 
718 aa  592  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  44.27 
 
 
688 aa  591  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  42.9 
 
 
700 aa  591  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  42.22 
 
 
674 aa  559  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  40.87 
 
 
665 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  42.72 
 
 
676 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  43.1 
 
 
680 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  40.8 
 
 
666 aa  538  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  41.59 
 
 
717 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  38.84 
 
 
743 aa  534  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  38.94 
 
 
741 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  39.97 
 
 
725 aa  528  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  37.8 
 
 
747 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  39.89 
 
 
725 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  42.34 
 
 
676 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  40.26 
 
 
666 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  39.51 
 
 
732 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  41.68 
 
 
723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  38.94 
 
 
713 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  39.53 
 
 
738 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  39.7 
 
 
720 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  38.67 
 
 
741 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  40.64 
 
 
668 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  39.48 
 
 
722 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  36.95 
 
 
717 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  37.5 
 
 
740 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  37.94 
 
 
740 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  37.9 
 
 
662 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  37.38 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  37.17 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  37.97 
 
 
728 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  38.04 
 
 
743 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  38.52 
 
 
721 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  38.76 
 
 
662 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  39.78 
 
 
669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  39.04 
 
 
665 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  38.33 
 
 
714 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  38.34 
 
 
662 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 
662 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  39.8 
 
 
649 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  38.48 
 
 
662 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  36.44 
 
 
664 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  38.2 
 
 
662 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  38.2 
 
 
662 aa  466  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  38.2 
 
 
662 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  38.06 
 
 
662 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  39.89 
 
 
716 aa  462  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  38.2 
 
 
662 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  38.06 
 
 
662 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  39.89 
 
 
664 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  36.58 
 
 
664 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  36.58 
 
 
664 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  37.87 
 
 
662 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  37.88 
 
 
704 aa  456  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  36.6 
 
 
753 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  37.2 
 
 
715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  36.18 
 
 
753 aa  455  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  38.29 
 
 
676 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 
631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  35.86 
 
 
708 aa  452  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  37.66 
 
 
631 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  35.44 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  35.58 
 
 
669 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  36.87 
 
 
712 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  36.16 
 
 
684 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  38.15 
 
 
784 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  35.17 
 
 
780 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  38.33 
 
 
848 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  41.76 
 
 
759 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 
774 aa  422  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  36.61 
 
 
691 aa  422  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  36.9 
 
 
785 aa  419  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  33.03 
 
 
816 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  35.92 
 
 
716 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  33.03 
 
 
816 aa  419  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  34.79 
 
 
778 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  36.46 
 
 
783 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  35.2 
 
 
665 aa  413  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  37.2 
 
 
786 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  35.11 
 
 
770 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  36.77 
 
 
776 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  35.24 
 
 
770 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  35.07 
 
 
749 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.44 
 
 
696 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 
625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  34.46 
 
 
774 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>