52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2961 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  41.94 
 
 
196 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.5 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35.55 
 
 
232 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
230 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  35.12 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  40.26 
 
 
192 aa  94.7  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
192 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  38.85 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  33.89 
 
 
206 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  37.58 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  34.81 
 
 
225 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  32.79 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  32.2 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
198 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  37.75 
 
 
180 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  33.51 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  36.6 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.1 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  33.11 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  32.54 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  35.33 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  32.6 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  44.29 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  34.42 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  21.52 
 
 
188 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  21.52 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  29.14 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 
171 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  39.44 
 
 
197 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 
194 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>