45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2853 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  83.33 
 
 
192 aa  252  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  68.91 
 
 
201 aa  248  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  64.8 
 
 
196 aa  222  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  59.3 
 
 
210 aa  217  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  62.44 
 
 
197 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  62.44 
 
 
197 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  62.44 
 
 
197 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  57.07 
 
 
210 aa  201  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  59.47 
 
 
224 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  59.79 
 
 
249 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  55.32 
 
 
223 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  54.97 
 
 
201 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  40.93 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  41.45 
 
 
200 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  44.44 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
185 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  22.39 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  36.05 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  52.83 
 
 
315 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  47.54 
 
 
326 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
109 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  51.11 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  22.47 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  33.01 
 
 
230 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
115 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  27.75 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 
112 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
111 aa  41.2  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>