More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2378 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  30.61 
 
 
6081 aa  1162    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  27.62 
 
 
3770 aa  717    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.02 
 
 
3470 aa  1238    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  31.34 
 
 
2174 aa  1103    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.52 
 
 
4317 aa  1112    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  32.38 
 
 
2387 aa  862    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.9 
 
 
5953 aa  1272    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.68 
 
 
6889 aa  1310    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.9 
 
 
2385 aa  1105    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.26 
 
 
4336 aa  1181    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.09 
 
 
2151 aa  1222    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  28.45 
 
 
3168 aa  833    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.54 
 
 
5929 aa  1002    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  30.13 
 
 
2391 aa  850    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.44 
 
 
3432 aa  1269    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.61 
 
 
4531 aa  1105    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.46 
 
 
2385 aa  1095    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  31.25 
 
 
2345 aa  919    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.32 
 
 
2385 aa  1098    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  30.11 
 
 
1726 aa  797    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.32 
 
 
2385 aa  1103    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  26.73 
 
 
3133 aa  780    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  30.39 
 
 
3328 aa  1049    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  28.66 
 
 
4186 aa  882    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.43 
 
 
3021 aa  1031    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.04 
 
 
4336 aa  1175    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  34.44 
 
 
2154 aa  1210    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  28.69 
 
 
3165 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.69 
 
 
5926 aa  1005    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.12 
 
 
9498 aa  1181    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.04 
 
 
5372 aa  1024    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.21 
 
 
5469 aa  879    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.17 
 
 
13537 aa  1192    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.53 
 
 
6676 aa  1304    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.96 
 
 
3629 aa  986    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.08 
 
 
2867 aa  931    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.47 
 
 
2791 aa  1013    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.54 
 
 
1142 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.65 
 
 
3308 aa  1359    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.45 
 
 
3498 aa  1312    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.97 
 
 
2033 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.71 
 
 
5328 aa  1177    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.65 
 
 
4383 aa  1066    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  28.85 
 
 
6274 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  33.06 
 
 
3395 aa  872    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  26.84 
 
 
4239 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  30.34 
 
 
6072 aa  1150    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  28.86 
 
 
4572 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  29.75 
 
 
3291 aa  1047    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  31.21 
 
 
5654 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.54 
 
 
4502 aa  1291    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  29.14 
 
 
2136 aa  869    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  29.67 
 
 
5422 aa  907    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.21 
 
 
4882 aa  1237    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.69 
 
 
3002 aa  1004    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.15 
 
 
4332 aa  1150    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  34.47 
 
 
2138 aa  1219    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  25.37 
 
 
3252 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.46 
 
 
2385 aa  1095    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  29.94 
 
 
4037 aa  856    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  28.63 
 
 
1801 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.13 
 
 
8646 aa  1149    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  27.72 
 
 
3650 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  27.33 
 
 
3296 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  31.08 
 
 
4290 aa  1029    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.03 
 
 
4489 aa  1120    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  29.51 
 
 
2605 aa  850    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  26.13 
 
 
3111 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  35.53 
 
 
3102 aa  1286    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  28.98 
 
 
4468 aa  994    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  29.75 
 
 
3348 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  24.94 
 
 
2174 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.89 
 
 
2457 aa  802    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  32.96 
 
 
1568 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  29.63 
 
 
2638 aa  745    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 
2410 aa  840    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.35 
 
 
3176 aa  1011    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 
3018 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.52 
 
 
4478 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.07 
 
 
2352 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.96 
 
 
4342 aa  1154    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.68 
 
 
5149 aa  978    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  32.49 
 
 
2189 aa  1130    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.33 
 
 
2448 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  28.22 
 
 
3524 aa  896    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 
2894 aa  1065    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  28.68 
 
 
6272 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.29 
 
 
2151 aa  864    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 
2477 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.27 
 
 
3291 aa  1313    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 
1992 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.12 
 
 
2199 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  30.39 
 
 
3352 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  29.82 
 
 
5467 aa  863    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  29.91 
 
 
2187 aa  944    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.44 
 
 
2370 aa  1288    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  28.85 
 
 
6271 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.42 
 
 
4317 aa  1119    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  26.61 
 
 
4265 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  30.34 
 
 
6006 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>