15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1949 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  276  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  54.41 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  39.1 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  36.09 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  35.51 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  36.15 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  35.24 
 
 
181 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  33.01 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  30.83 
 
 
175 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  27.87 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  28.87 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>