23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7625 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  100 
 
 
451 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  43.46 
 
 
308 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  42.38 
 
 
314 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  45.77 
 
 
318 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  42.01 
 
 
360 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  47.14 
 
 
297 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  37.34 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  48.84 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  34.06 
 
 
340 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  47.11 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  39.29 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  45.49 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  36.84 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  35.59 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  28.62 
 
 
308 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  23.21 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  27.56 
 
 
305 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  29.73 
 
 
327 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  25.51 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>