15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4189 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  959    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.41 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5662  hypothetical protein  27.33 
 
 		 671 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3726  membrane protein-like  26.49 
 
 		 671 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4642  membrane protein-like protein  26.49 
 
 		 671 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.06 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  30.72 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  29.41 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  32.39 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  28.43 
 
 		 734 aa  50.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.3 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.87 
 
 		 717 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.87 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.77 
 
 		 719 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 764 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>