202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3342 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  40.41 
 
 
198 aa  172  4e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  30.35 
 
 
201 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
192 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.05 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.43 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.42 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
191 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
193 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.05 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.49 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.99 
 
 
199 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 
198 aa  85.5  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.14 
 
 
195 aa  83.2  3e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  24.87 
 
 
193 aa  83.6  3e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  7.73634e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.53 
 
 
195 aa  83.6  3e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 
193 aa  82.8  4e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.41 
 
 
194 aa  82.4  5e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.27 
 
 
199 aa  82  7e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1100  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
195 aa  80.9  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242851  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.94 
 
 
205 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
507 aa  81.3  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  32.77 
 
 
189 aa  80.9  2e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  27.17 
 
 
207 aa  79.3  4e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
195 aa  79.3  4e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 
194 aa  78.6  8e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 
198 aa  78.6  8e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
195 aa  78.6  8e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
195 aa  78.2  9e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  27.17 
 
 
207 aa  78.2  1e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
195 aa  77.8  1e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.74 
 
 
192 aa  77.8  1e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 
198 aa  76.6  3e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
200 aa  76.3  3e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.57 
 
 
206 aa  76.3  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.78 
 
 
507 aa  75.9  6e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.2 
 
 
193 aa  74.7  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
193 aa  74.7  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.2 
 
 
193 aa  73.9  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.2 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  37.41 
 
 
195 aa  73.6  2e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.2 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
193 aa  73.2  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
216 aa  73.2  3e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
193 aa  73.2  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.33 
 
 
209 aa  72.8  4e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
197 aa  72.8  4e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  36.59 
 
 
193 aa  73.2  4e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 
192 aa  72.8  5e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.76 
 
 
194 aa  72.4  5e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  25.6 
 
 
191 aa  72.4  6e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
222 aa  72.4  6e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 
197 aa  71.6  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.6 
 
 
191 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.36 
 
 
193 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
193 aa  71.2  1e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  8.46124e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 
191 aa  71.6  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.36 
 
 
193 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  34.04 
 
 
194 aa  71.2  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.77 
 
 
191 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.77 
 
 
191 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 
199 aa  71.2  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.93 
 
 
191 aa  70.9  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  25.49 
 
 
191 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.82 
 
 
197 aa  70.9  2e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.93 
 
 
191 aa  70.9  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.41 
 
 
206 aa  70.5  2e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.49 
 
 
191 aa  70.1  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.77 
 
 
191 aa  70.9  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
200 aa  70.5  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48 
 
 
193 aa  69.3  4e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  37.1 
 
 
203 aa  69.3  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  31.36 
 
 
193 aa  69.7  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
195 aa  69.7  4e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.63 
 
 
237 aa  69.7  4e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 
218 aa  69.3  5e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
197 aa  68.6  7e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
193 aa  68.9  7e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  31.51 
 
 
213 aa  67.8  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
192 aa  68.2  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  36.29 
 
 
201 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.54354e-09  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  34.96 
 
 
198 aa  67.8  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  29.26 
 
 
192 aa  68.2  1e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
193 aa  67.4  2e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  33.77 
 
 
211 aa  66.6  3e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
244 aa  66.6  3e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.83 
 
 
249 aa  66.6  3e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
198 aa  65.9  5e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
233 aa  65.9  6e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
194 aa  65.5  6e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 
194 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
197 aa  64.7  1e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 
198 aa  64.7  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.335878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  37.72 
 
 
235 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
263 aa  64.3  2e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 
194 aa  64.3  2e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
197 aa  64.3  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
200 aa  64.3  2e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>