47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3150 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  100 
 
 
488 aa  948    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  35.38 
 
 
467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  35.68 
 
 
472 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  30.43 
 
 
479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  29.5 
 
 
453 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  31.31 
 
 
483 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  30.8 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  31.05 
 
 
481 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  31.14 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  31.16 
 
 
510 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  30.33 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  33.2 
 
 
459 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  29.16 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  28.3 
 
 
540 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  29.22 
 
 
454 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  27.62 
 
 
464 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  28.21 
 
 
459 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  27.85 
 
 
506 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  29.2 
 
 
496 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  28.66 
 
 
510 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  26.97 
 
 
465 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  29.52 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  28.8 
 
 
516 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  25.24 
 
 
519 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  28.8 
 
 
516 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  28.8 
 
 
516 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  27.09 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  29.42 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  29.42 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  29.42 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  26.81 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  23.63 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  27.49 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  27.25 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  27.92 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  27.92 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  27.43 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  25.25 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  27.48 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  25.6 
 
 
493 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  30.95 
 
 
482 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  26.89 
 
 
495 aa  57  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  25.93 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  26.72 
 
 
495 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  26.24 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  26.52 
 
 
491 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  26.24 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>