16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1013 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  4.40663e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  95.98 
 
 
224 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  9.61119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  42.04 
 
 
229 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  7.17083e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  36.45 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  29.96 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  34.73 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  28.44 
 
 
227 aa  82.8  4e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  32.54 
 
 
234 aa  69.7  3e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  29.46 
 
 
238 aa  69.3  5e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  33.87 
 
 
236 aa  64.3  1e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  33.05 
 
 
343 aa  55.8  5e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  32.77 
 
 
291 aa  53.9  2e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  29.75 
 
 
229 aa  49.3  4e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  38.78 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  42.31 
 
 
642 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  24.63 
 
 
222 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>