13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  100 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  46.88 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  45.16 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  43.69 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  45.83 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  36.45 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  34.35 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  31.02 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  29.46 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  30.89 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  29.29 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>