14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3048 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  57.96 
 
 
227 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  49.1 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  47.53 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  45.98 
 
 
238 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  39.25 
 
 
229 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  31.44 
 
 
229 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  38.46 
 
 
234 aa  104  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  40.21 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  35.71 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  34.42 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  28.57 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  31.01 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
483 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>