15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1182 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  95.98 
 
 
224 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  37.67 
 
 
229 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  36.45 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  30.87 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  34.09 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  29.28 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  34.12 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  30.45 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  34.68 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  34.21 
 
 
343 aa  55.1  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  32.76 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  30.58 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  27.16 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
224 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>