More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0777 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  97.47 
 
 
198 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  69.7 
 
 
198 aa  291  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.21 
 
 
201 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  42.18 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  42.31 
 
 
208 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  42.31 
 
 
208 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  39.42 
 
 
208 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  38.46 
 
 
208 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  38.46 
 
 
208 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  38.46 
 
 
208 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  38.46 
 
 
208 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  38.46 
 
 
208 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  37.98 
 
 
208 aa  151  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  37.98 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  37.98 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  37.5 
 
 
208 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 
210 aa  147  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  36.02 
 
 
211 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  143  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  36.02 
 
 
211 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  36.02 
 
 
211 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  35.55 
 
 
211 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.52 
 
 
210 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  35.07 
 
 
211 aa  140  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
210 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  36.54 
 
 
230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.51 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  37.62 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  37.14 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  37.14 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  37.14 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  37.14 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  37.14 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  37.14 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  37.14 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  36.26 
 
 
199 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  36.19 
 
 
230 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
199 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
204 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 
199 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.74 
 
 
199 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  38.42 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  33.67 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  33.67 
 
 
201 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  37.21 
 
 
201 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  37.21 
 
 
201 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  37.21 
 
 
201 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.7 
 
 
209 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  41.73 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.79 
 
 
202 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  37.79 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  30.65 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  36.26 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.14 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.01 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.79 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  37.79 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  37.79 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  38.01 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  37.79 
 
 
201 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  37.79 
 
 
201 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  36.63 
 
 
201 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.31 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.11 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.04 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  37.21 
 
 
201 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 
213 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.95 
 
 
213 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.8 
 
 
237 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.8 
 
 
198 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.8 
 
 
198 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.8 
 
 
237 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.8 
 
 
237 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.8 
 
 
237 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.8 
 
 
237 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
198 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.43 
 
 
216 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.56 
 
 
198 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  31.66 
 
 
201 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.49 
 
 
203 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  34.5 
 
 
201 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  34.5 
 
 
201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  34.5 
 
 
201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.12 
 
 
194 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  34.5 
 
 
201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  34.5 
 
 
201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
198 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>