119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2253 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  100 
 
 
411 aa  845    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  99.03 
 
 
411 aa  838    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  58.39 
 
 
409 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  55.23 
 
 
413 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  56.93 
 
 
413 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  53.43 
 
 
409 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  53.68 
 
 
409 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  53.19 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  53.19 
 
 
409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  52.94 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  52.94 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  53.19 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  53.19 
 
 
409 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  52.7 
 
 
409 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  52.94 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  52.94 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  51.1 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  46.99 
 
 
410 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  44.25 
 
 
409 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  47.22 
 
 
413 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  45.28 
 
 
415 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  45.28 
 
 
415 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  44.74 
 
 
410 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  43.32 
 
 
416 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  41.67 
 
 
421 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  43.63 
 
 
409 aa  362  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  43.63 
 
 
423 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  44.25 
 
 
413 aa  360  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  42.16 
 
 
419 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  41.63 
 
 
418 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  41.42 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  43.07 
 
 
420 aa  357  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  41.42 
 
 
419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  43.14 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  41.52 
 
 
418 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  40.53 
 
 
413 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  42.61 
 
 
420 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  44.73 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  40.93 
 
 
411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  43.18 
 
 
418 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  41.42 
 
 
413 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  42.43 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  39.41 
 
 
418 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  42.51 
 
 
416 aa  341  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  42.18 
 
 
417 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  42.18 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  39.01 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  42.47 
 
 
400 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  40.94 
 
 
417 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  40.69 
 
 
418 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  41.42 
 
 
409 aa  332  6e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  40.2 
 
 
418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  39.95 
 
 
417 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  39.45 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  39.21 
 
 
418 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  38.71 
 
 
423 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  34.89 
 
 
399 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  36.56 
 
 
412 aa  247  3e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  28.75 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  27.56 
 
 
406 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  25.62 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  25.63 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  24.18 
 
 
357 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  27.6 
 
 
368 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  26.6 
 
 
403 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  28.12 
 
 
410 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  25.46 
 
 
399 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  25.06 
 
 
367 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  24.51 
 
 
359 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  27.54 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  27.42 
 
 
405 aa  99  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  27.3 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  26.53 
 
 
401 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  27.64 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  24.94 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  25.13 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  27.07 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  27.78 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  24.94 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  29.63 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  25.72 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  26.4 
 
 
368 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  27.63 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  23.65 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  36.62 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  23.94 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  23.76 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  23.08 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  23.33 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  22.82 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  30.77 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  26.12 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  26.13 
 
 
369 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  26.76 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  24.56 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  26.99 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  24.02 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  23.68 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  22.7 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  37.04 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>