178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2251 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  55.3 
 
 
307 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  53.77 
 
 
306 aa  358  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  54.3 
 
 
307 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  52.81 
 
 
309 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  51.83 
 
 
307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  324  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  52.48 
 
 
309 aa  324  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  51.5 
 
 
308 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  52.15 
 
 
309 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  52.15 
 
 
309 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  50.99 
 
 
308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  47.13 
 
 
326 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  47.13 
 
 
326 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  48.2 
 
 
318 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  50 
 
 
334 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  46.82 
 
 
326 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  46.82 
 
 
326 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  46.82 
 
 
326 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  47.35 
 
 
306 aa  292  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  46.82 
 
 
326 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  46.5 
 
 
326 aa  291  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  46.5 
 
 
326 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  49.18 
 
 
343 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  50.87 
 
 
333 aa  288  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  49.18 
 
 
343 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  48.99 
 
 
624 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  45.21 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  45.99 
 
 
624 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  46.69 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  45.45 
 
 
425 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  43.52 
 
 
412 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  43.61 
 
 
343 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  44.6 
 
 
613 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  45.25 
 
 
331 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  40.53 
 
 
309 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  41.83 
 
 
309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  42.61 
 
 
601 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  41.72 
 
 
304 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  40.2 
 
 
422 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  40.79 
 
 
304 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  40.79 
 
 
304 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  40.79 
 
 
304 aa  242  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  42.47 
 
 
311 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  43.34 
 
 
311 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  43.54 
 
 
304 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  41.39 
 
 
304 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  43.34 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  41.39 
 
 
304 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  40.73 
 
 
304 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  39.8 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  41.5 
 
 
309 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  41.83 
 
 
309 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  41.06 
 
 
304 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  41.06 
 
 
304 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  43.14 
 
 
309 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  42.36 
 
 
315 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  40.4 
 
 
306 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  43.79 
 
 
309 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  41.12 
 
 
304 aa  235  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  40.79 
 
 
306 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  42.81 
 
 
309 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  39.29 
 
 
304 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  39.29 
 
 
304 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  41.18 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  40.46 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  41.18 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  41.72 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  40.53 
 
 
316 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  40.07 
 
 
308 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.27 
 
 
306 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  43.1 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  37.18 
 
 
483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  38.96 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  40.07 
 
 
308 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  40.07 
 
 
308 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  39.53 
 
 
308 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  40.68 
 
 
304 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  38.96 
 
 
304 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  40.73 
 
 
307 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  39.14 
 
 
304 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  39.53 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  40.4 
 
 
304 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  40 
 
 
333 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  40.73 
 
 
304 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  40.52 
 
 
309 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>