27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0040 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0040  inner membrane protein YagU  100 
 
 		 49 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1319  S-adenosylmethionine synthetase  84.78 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00246  conserved inner membrane protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00249  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0333  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0313  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0362655  hitchhiker  0.00720742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3332  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0298  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3212  protein of unknown function DUF1440  56.52 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.269877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3317  protein of unknown function DUF1440  56.52 
 
 		 204 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4729  inner membrane protein YagU  60 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4657  inner membrane protein YagU  55.56 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4667  inner membrane protein YagU  55.56 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2282  hypothetical protein  54.35 
 
 		 208 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0429  hypothetical protein  52.17 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0508  protein of unknown function DUF1440  52.17 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3478  protein of unknown function DUF1440  51.02 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0766  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1474  hypothetical protein  55.88 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0851  hypothetical protein  45.24 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0463  hypothetical protein  53.66 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00263232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0171  hypothetical protein  51.35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0166  hypothetical protein  51.35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0487  periplasmic/secreted protein  48.57 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0671981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0105  periplasmic/secreted protein  47.06 
 
 		 179 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000252803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0911  hypothetical protein  42.42 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1743  periplasmic/secreted protein  42.86 
 
 		 167 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>