19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0388 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  723    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  60.53 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  53.59 
 
 
332 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  52.24 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  43.98 
 
 
341 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  42.68 
 
 
326 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  40.3 
 
 
330 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  39.94 
 
 
331 aa  245  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  29.45 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  28.66 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  29.57 
 
 
327 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  29.47 
 
 
323 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  24.05 
 
 
1055 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  24.14 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  23.45 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  23.91 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  24.54 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  24.35 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>