39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0793 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0793  Plp4  100 
 
 
138 aa  286  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192508  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  39.55 
 
 
292 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5708  hypothetical protein  36.89 
 
 
229 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  32.06 
 
 
298 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  34.78 
 
 
273 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.15 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.15 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  31.15 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  31.15 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.15 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.15 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  34.31 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  28.35 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 
277 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 
278 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  28.87 
 
 
290 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  28.97 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  31.75 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4599  hypothetical protein  28.21 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.75 
 
 
204 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 
276 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.43 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  30.43 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  24.35 
 
 
228 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.43 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.26 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.37 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.43 
 
 
265 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.43 
 
 
265 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.09 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  28.95 
 
 
276 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  30.43 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.95 
 
 
242 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  28.95 
 
 
251 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.95 
 
 
279 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.95 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.95 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.95 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>