17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4599 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4599  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  30.85 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  30.34 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  30.34 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  30.34 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  32.63 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5708  hypothetical protein  30.21 
 
 		 229 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0793  Plp4  28.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192508  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  29.67 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 		 264 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  24.24 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>