More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1672 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1585  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  98.04 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0014  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000021205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>