17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2129 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  72.87 
 
 
188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  50.33 
 
 
177 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  44.19 
 
 
175 aa  148  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  43.83 
 
 
172 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  43.83 
 
 
172 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  41.88 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  39.39 
 
 
171 aa  117  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  38.32 
 
 
170 aa  94  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1116  hypothetical protein  27.45 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  30.69 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  29.13 
 
 
938 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  29.13 
 
 
1018 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  29.13 
 
 
938 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  29.13 
 
 
1018 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  29.13 
 
 
938 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  29.13 
 
 
938 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>