283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4772 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  72.26 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  70.9 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  62.24 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  61.54 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  61.54 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  57.75 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  58.82 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  58.82 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.29 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50.35 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.85 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5925  hypothetical protein  51.13 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.74 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  52.9 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  49.63 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  49.25 
 
 		 279 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.13 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  52.21 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  52.21 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.24 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.89 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.24 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.53 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.49 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.49 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.49 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  48.53 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  51.49 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.37 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  48.89 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  48.89 
 
 		 260 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  48.15 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  48.15 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  48.15 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  48.15 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1012  glyoxalase family protein  48.15 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0961  glyoxalase family protein  48.15 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.18 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  46.97 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.71 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1375  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.65 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.12 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  44.6 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.36 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.85 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.91 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364708  normal  0.0270793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0310  hypothetical protein  37.23 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0504777 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4543  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4634  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.872407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4634  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4550  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4683  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4168  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.42 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0156126  hitchhiker  0.00300436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.73608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.19 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2265  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.14 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4475  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.46 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1958  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.73 
 
 		 152 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2613  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.81 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1934  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.52 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.358523  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0411  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.76 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195958  normal  0.144933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4028  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.48 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0559791  normal  0.357373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4598  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3596  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000394768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4456  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5280  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.88 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3665  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.41 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.56 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3682  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.23 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.867816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1590  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309369  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0029  PhnB protein  37.21 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403111  normal  0.0726467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>