208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4515 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 
148 aa  306  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.867816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3665  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  83.78 
 
 
148 aa  263  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5280  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  83.67 
 
 
148 aa  260  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.73 
 
 
148 aa  257  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309369  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3682  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.14 
 
 
142 aa  247  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2265  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44 
 
 
150 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289163  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.33 
 
 
150 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4028  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.61 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0559791  normal  0.357373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  42.55 
 
 
137 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.85 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1375  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.91 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.34 
 
 
139 aa  105  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364708  normal  0.0270793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  42.34 
 
 
137 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  42.34 
 
 
137 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.57 
 
 
137 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.24 
 
 
144 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.85 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.23 
 
 
135 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 
136 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  36.96 
 
 
137 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.96 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.93 
 
 
137 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.44 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.69 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.69 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.69 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4683  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4543  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.69 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4634  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.872407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4550  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.69 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4634  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  36.36 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.04 
 
 
139 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.5 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0411  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195958  normal  0.144933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  34.35 
 
 
279 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.47 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  35.46 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  34.72 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0310  hypothetical protein  35.81 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0504777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.69 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  32.41 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.56 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0961  glyoxalase family protein  36.69 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398511  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 
143 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 
143 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.96 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  36.69 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  36.69 
 
 
260 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  33.83 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  35.97 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1012  glyoxalase family protein  35.97 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  35.97 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  35.97 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  35.97 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  33.08 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  33.58 
 
 
284 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4168  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.46 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0156126  hitchhiker  0.00300436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  32.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  32.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.23 
 
 
139 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  32.33 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5925  hypothetical protein  35.42 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.47 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4475  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  35.56 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  34.33 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.31 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000314859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1958  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.33 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.73608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2613  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.21 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.57 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31410  hypothetical protein  35.25 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20440  hypothetical protein  36.84 
 
 
163 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.565275  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1560  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.35 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.65 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>