More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3042 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.4 
 
 
801 aa  835    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.1 
 
 
784 aa  756    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  51.57 
 
 
798 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  54.17 
 
 
799 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  69.14 
 
 
792 aa  1046    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.67 
 
 
796 aa  794    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  54.32 
 
 
780 aa  744    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.66 
 
 
792 aa  767    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  67.01 
 
 
787 aa  938    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  51.04 
 
 
839 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  67.32 
 
 
787 aa  1014    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  67.31 
 
 
793 aa  1075    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  48.11 
 
 
772 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  67.14 
 
 
787 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  53.25 
 
 
797 aa  790    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.94 
 
 
777 aa  794    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  51.21 
 
 
825 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  100 
 
 
800 aa  1640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  66.45 
 
 
784 aa  1015    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  64.49 
 
 
830 aa  941    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  53.92 
 
 
781 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.93 
 
 
779 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  64.03 
 
 
816 aa  991    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  66.88 
 
 
787 aa  941    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.3 
 
 
797 aa  797    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  66.08 
 
 
788 aa  1073    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.74 
 
 
767 aa  710    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  67.01 
 
 
787 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.03 
 
 
793 aa  781    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  50.87 
 
 
812 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.03 
 
 
797 aa  808    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.32 
 
 
794 aa  810    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51 
 
 
779 aa  750    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  56.26 
 
 
801 aa  804    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  94.26 
 
 
802 aa  1527    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.31 
 
 
799 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  65.49 
 
 
788 aa  997    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  65.7 
 
 
788 aa  1071    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.66 
 
 
779 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  65.36 
 
 
785 aa  1010    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  67.14 
 
 
787 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  52.23 
 
 
797 aa  734    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.27 
 
 
781 aa  752    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  49.48 
 
 
856 aa  750    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  67.05 
 
 
783 aa  1042    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  49.24 
 
 
800 aa  693    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50.32 
 
 
782 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  67.01 
 
 
787 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  54.72 
 
 
777 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  66.93 
 
 
787 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  67.14 
 
 
787 aa  940    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.57 
 
 
779 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  51.63 
 
 
784 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  63.91 
 
 
808 aa  993    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  66.45 
 
 
814 aa  935    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.56 
 
 
799 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  56.27 
 
 
781 aa  812    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  67.06 
 
 
787 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  53.19 
 
 
799 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.21 
 
 
825 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  67.19 
 
 
787 aa  1015    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.37 
 
 
804 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  85.64 
 
 
818 aa  1326    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  62.6 
 
 
812 aa  946    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  54.31 
 
 
770 aa  801    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  53.19 
 
 
799 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  64.3 
 
 
787 aa  995    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.58 
 
 
788 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  66.93 
 
 
787 aa  997    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.19 
 
 
764 aa  745    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.02 
 
 
799 aa  804    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.03 
 
 
785 aa  801    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  54.75 
 
 
823 aa  797    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.97 
 
 
799 aa  857    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  65.62 
 
 
788 aa  1000    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.27 
 
 
801 aa  831    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  67.01 
 
 
787 aa  938    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  67.59 
 
 
784 aa  999    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.84 
 
 
828 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  47.19 
 
 
767 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  40.08 
 
 
1363 aa  534  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 
1350 aa  525  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  39.47 
 
 
769 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  39.49 
 
 
1387 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  58.87 
 
 
825 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.8 
 
 
754 aa  335  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  28.27 
 
 
730 aa  277  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  30.12 
 
 
715 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  30.84 
 
 
774 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1362  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  29.57 
 
 
800 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.79134  normal  0.0266884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.86 
 
 
772 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2839  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  30.55 
 
 
785 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4113  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  31.44 
 
 
772 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125612  normal  0.863798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  28 
 
 
753 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  27.73 
 
 
713 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.5 
 
 
714 aa  237  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5751  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  29.31 
 
 
940 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.373125  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5518  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.55 
 
 
940 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2542  xanthine dehydrogenase D subunit  30.11 
 
 
781 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0400659  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1240  xanthine dehydrogenase D subunit  30.78 
 
 
749 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0236339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>