65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1968 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  68.43 
 
 
738 aa  1036    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  68.29 
 
 
738 aa  1025    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  68.16 
 
 
738 aa  1034    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  68.16 
 
 
738 aa  1034    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  68.75 
 
 
722 aa  979    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  95.36 
 
 
733 aa  1438    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  72.3 
 
 
727 aa  1052    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  68.61 
 
 
669 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  70.45 
 
 
775 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  72.3 
 
 
718 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  68.61 
 
 
669 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  68.29 
 
 
738 aa  1032    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  68.02 
 
 
738 aa  1032    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  69.3 
 
 
730 aa  1030    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  72.16 
 
 
722 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  75.53 
 
 
761 aa  1127    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  47.55 
 
 
727 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  100 
 
 
733 aa  1492    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  68.75 
 
 
669 aa  975    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  46.29 
 
 
729 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  47.17 
 
 
808 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  36.96 
 
 
708 aa  479  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  38.59 
 
 
743 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  34.76 
 
 
663 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 
644 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  25.39 
 
 
644 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  26.2 
 
 
640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 
644 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  25.8 
 
 
640 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  25.53 
 
 
638 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  26.01 
 
 
713 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  25.1 
 
 
638 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  25.1 
 
 
638 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  25.27 
 
 
638 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  24.76 
 
 
644 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  24.37 
 
 
644 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  24.87 
 
 
630 aa  147  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  24.87 
 
 
630 aa  147  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.37 
 
 
644 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  25.03 
 
 
660 aa  145  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  25.47 
 
 
711 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  25.21 
 
 
640 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  25.2 
 
 
638 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  24.23 
 
 
641 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  24.23 
 
 
641 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  25.3 
 
 
638 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  24.31 
 
 
650 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  25.03 
 
 
640 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  24.2 
 
 
647 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  24.31 
 
 
641 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  24.31 
 
 
641 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  25.77 
 
 
644 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  24.31 
 
 
641 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  24.23 
 
 
641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  24.18 
 
 
650 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  24.1 
 
 
638 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  24.1 
 
 
638 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  24.1 
 
 
638 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  24.1 
 
 
638 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  24.27 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.91 
 
 
643 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  24.06 
 
 
638 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  23.92 
 
 
638 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  23.68 
 
 
638 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  23.67 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>