264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3518 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
422 aa  850    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.79 
 
 
445 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.57 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.81 
 
 
441 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.88 
 
 
441 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.43 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.95 
 
 
441 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.75 
 
 
447 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.48 
 
 
444 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.73 
 
 
441 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.28 
 
 
438 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.25 
 
 
441 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.06 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.05 
 
 
446 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.48 
 
 
453 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.87 
 
 
453 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.57 
 
 
441 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
460 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.87 
 
 
429 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.4 
 
 
438 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.72 
 
 
453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.24 
 
 
438 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.36 
 
 
431 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.09 
 
 
435 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.41 
 
 
436 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.41 
 
 
436 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.64 
 
 
436 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.61 
 
 
436 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.38 
 
 
429 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.91 
 
 
436 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.11 
 
 
450 aa  289  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 
482 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
464 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.19 
 
 
464 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.16 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.59 
 
 
454 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.55 
 
 
464 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.56 
 
 
454 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.1 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.26 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.12 
 
 
467 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.26 
 
 
460 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
460 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.24 
 
 
467 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 
454 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.57 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.39 
 
 
441 aa  242  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.52 
 
 
458 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.68 
 
 
460 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.88 
 
 
462 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.1 
 
 
466 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.63 
 
 
480 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 
430 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  38.21 
 
 
435 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.95 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.22 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.18 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.98 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.18 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.18 
 
 
454 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5366  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.98 
 
 
465 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
489 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2257  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.53 
 
 
459 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2211  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.28 
 
 
459 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2157  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.28 
 
 
459 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.28 
 
 
459 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.44 
 
 
454 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0343  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  38.59 
 
 
506 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1429  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  36.74 
 
 
447 aa  226  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 
434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1007  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
442 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.91 
 
 
434 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239276  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.02 
 
 
459 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 
458 aa  226  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 
475 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.1 
 
 
443 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1551  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.8 
 
 
435 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1651  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.06 
 
 
436 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.63 
 
 
538 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  39.31 
 
 
457 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.6 
 
 
440 aa  223  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4034  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.62 
 
 
427 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.75 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  36.08 
 
 
439 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3379  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.51 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.18716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0119  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  37.05 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1039  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  37.2 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000825855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.93 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0220  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.52 
 
 
447 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 
551 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0028663  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.92 
 
 
456 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.45 
 
 
475 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5859  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.41 
 
 
465 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.29 
 
 
437 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0309  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
456 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1935  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  37.41 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4799  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.51 
 
 
437 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305873  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0787  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2672  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>