13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  417  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  39.2 
 
 
882 aa  81.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  36.42 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  36.76 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  30.3 
 
 
492 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  30.73 
 
 
615 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  34.78 
 
 
471 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  31.67 
 
 
631 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  32.28 
 
 
543 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  33.09 
 
 
808 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  32.61 
 
 
525 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  32.87 
 
 
442 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  33.09 
 
 
485 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>