20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4248 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  40.06 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 437 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  25.08 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.08 
 
 		 1276 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.65 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  30.61 
 
 		 864 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.28 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.28 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.28 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.4 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  26.35 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  28.32 
 
 		 873 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.7 
 
 		 442 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.05 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  29.13 
 
 		 596 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  22.32 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  27.86 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>