66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3983 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 354 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  94.92 
 
 		 358 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  99.15 
 
 		 354 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.23 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.51 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.94 
 
 		 358 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  48.55 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  46.8 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  49.26 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  46.13 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  45.85 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  44.28 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  45.24 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  45.45 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  41.59 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.91 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  39.19 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  37.03 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  41.23 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  35.07 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  41.37 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  24.61 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  24.29 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.22 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  21.49 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  34.95 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0134  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.7 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.73 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1912  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  25.36 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4562  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.59 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  20.99 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08130  ABC transporter, sulfate ester binding protein  22.19 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  20.99 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.47 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.4 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.47 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2160  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  36.96 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.486423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  31.86 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  20.99 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.47 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.23 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1833  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  30.97 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2096  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  35.87 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  20.99 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  20.99 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08170  sulfate ester transport system substrate-binding protein  30.97 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  31.25 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1433  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  30.09 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.02 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.04 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2186  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.65 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  0.269946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  20.61 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.27 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  27.13 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.78 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  27.13 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.58 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.94 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.71 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0577  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.35 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0251  putative sulfonate binding protein precursor  24.1 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  20.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>