119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1112 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
137 aa  272  1e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  83.33 
 
 
135 aa  211  2e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  82.61 
 
 
135 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  67.86 
 
 
141 aa  179  8e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  68.12 
 
 
141 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  66.43 
 
 
141 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  67.88 
 
 
140 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  67.88 
 
 
140 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  67.86 
 
 
141 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  66.43 
 
 
141 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  66.43 
 
 
141 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  67.14 
 
 
141 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  65.94 
 
 
141 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  65.94 
 
 
141 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  65.94 
 
 
141 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  56.18 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  52.87 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  61.04 
 
 
87 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  54.02 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  54.02 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  50.57 
 
 
178 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  51.72 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 
136 aa  82.4  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  52.56 
 
 
86 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  32.33 
 
 
133 aa  70.1  1e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  47.67 
 
 
89 aa  64.3  5e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 
93 aa  63.9  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  41.46 
 
 
89 aa  63.2  1e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  39 
 
 
94 aa  61.2  5e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  44.32 
 
 
88 aa  60.8  6e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  42.35 
 
 
86 aa  60.5  7e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  40.48 
 
 
87 aa  60.1  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  38.55 
 
 
89 aa  59.3  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  41.03 
 
 
83 aa  59.3  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  41.18 
 
 
453 aa  59.3  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 
92 aa  57  9e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  41.18 
 
 
194 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  39.13 
 
 
94 aa  56.2  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  40 
 
 
81 aa  55.8  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  38.04 
 
 
94 aa  55.5  2e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  40 
 
 
101 aa  55.5  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  34.18 
 
 
84 aa  55.8  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 
83 aa  56.2  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  38.04 
 
 
94 aa  55.5  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  43.9 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  40 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 
94 aa  55.1  3e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  41.89 
 
 
86 aa  55.1  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 
83 aa  55.1  4e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  44.19 
 
 
107 aa  54.3  5e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  36.96 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  54.3  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  53.5  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  36.25 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  42.35 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  39.08 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  36.96 
 
 
94 aa  52.4  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  36.96 
 
 
94 aa  52.4  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  36.96 
 
 
92 aa  52.4  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  37.21 
 
 
87 aa  52  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 
83 aa  52  3e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  38.67 
 
 
83 aa  51.6  4e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  35.79 
 
 
93 aa  50.1  9e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  41.57 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  39.76 
 
 
102 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  42.7 
 
 
88 aa  50.1  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  40.22 
 
 
92 aa  50.1  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  35.9 
 
 
83 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  35.56 
 
 
191 aa  48.1  4e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
88 aa  48.1  4e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  34.62 
 
 
83 aa  47.8  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  37.33 
 
 
615 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  34.17 
 
 
178 aa  47  9e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  36.14 
 
 
86 aa  47  9e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  37.65 
 
 
88 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  31.3 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  43.24 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  32.97 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  36.25 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  34.09 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  39.02 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  34.57 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  26.67 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>