16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0018 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1161    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  23.24 
 
 
638 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  23.24 
 
 
638 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  23.24 
 
 
638 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  23.24 
 
 
638 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  36.71 
 
 
849 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  36.71 
 
 
849 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  36.05 
 
 
410 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  24.61 
 
 
605 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  40.26 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  34.04 
 
 
183 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  35.94 
 
 
410 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  28.3 
 
 
628 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  31.58 
 
 
568 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>