47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3956 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  46.72 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  41.95 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  33.95 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  38.07 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  27.73 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  29.8 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  28.46 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  26.32 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  26.14 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  26.14 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  26.75 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  26.14 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  25.73 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  25.73 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  26.05 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  36.13 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  28.57 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  35.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  35.97 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  28.16 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  29.64 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  29.63 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  33.07 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  29.32 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  28.07 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  28.44 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  40.43 
 
 		 331 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 344 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1516  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 229 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>