12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1888 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  100 
 
 		 309 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  44.67 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  42.81 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  44.44 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  44.49 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  42.11 
 
 		 507 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  41.92 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  39.79 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  37.92 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  34.08 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  30.72 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>