More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1850 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  69.89 
 
 
234 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  69.73 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  70.22 
 
 
202 aa  256  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  70.22 
 
 
219 aa  255  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  69.1 
 
 
200 aa  254  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  64.43 
 
 
214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  69.57 
 
 
205 aa  251  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  67.76 
 
 
216 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  66.49 
 
 
214 aa  248  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  64.55 
 
 
199 aa  244  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  67.39 
 
 
205 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  67.39 
 
 
193 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  64.48 
 
 
206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  69.32 
 
 
206 aa  241  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  67.21 
 
 
214 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  62.05 
 
 
202 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  65.05 
 
 
207 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  66.31 
 
 
209 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  60.2 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  62.77 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  60.2 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  62.37 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  60.2 
 
 
201 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  65.22 
 
 
222 aa  231  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  65.36 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 
195 aa  230  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  62.23 
 
 
194 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  62.64 
 
 
188 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  62.03 
 
 
202 aa  227  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 
189 aa  226  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  62.57 
 
 
202 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  64.25 
 
 
200 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  62.37 
 
 
257 aa  225  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  62.7 
 
 
198 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 
187 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  60.43 
 
 
220 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  64.41 
 
 
219 aa  221  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 
194 aa  220  9e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  60.73 
 
 
217 aa  220  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 
187 aa  218  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 
185 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  60.99 
 
 
185 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 
188 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  56.84 
 
 
192 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 
186 aa  214  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  59.43 
 
 
188 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 
206 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 
189 aa  208  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  58.79 
 
 
188 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
189 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
189 aa  207  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 
188 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  56.77 
 
 
195 aa  206  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
195 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 
207 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
185 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
185 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 
227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  52.79 
 
 
219 aa  190  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 
190 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  47.8 
 
 
187 aa  188  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  51.1 
 
 
190 aa  188  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 
223 aa  188  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  55.19 
 
 
198 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 
190 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  54.34 
 
 
202 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 
190 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  52.28 
 
 
223 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 
219 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
218 aa  184  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
247 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
185 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  50.53 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
181 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 
216 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
239 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 
211 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 
181 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
239 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  50.57 
 
 
195 aa  176  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 
190 aa  175  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>